L'ultimatum d'Ouranos arrive à son échéance. Depuis leur dernière rencontre avec Fujii, les deux parties savent qu'il n'y a plus de retour en arrière possible dans cette guerre qui s'annonce dévastatrice. Fujii se perfectionne alors dans le maniement des armes auprès de Hosa afin de prendre une part active dans cette bataille entre hunters et biorgs. Toutefois, l'imminence des événements le pousse à accepter l'inévitable : s'il veut sauver celle qu'il aime, il va devoir laisser de côté sa conscience, voire se sacrifier pour mener à bien sa mission. Poussé dans ses extrémités, il va trouver le courage d'enfin laisser parler son coeur...

Fujii se réveille sans réellement avoir conscience de ce qui lui est arrivé. Mais la situation n'a pas échappé à Kiwako : sa fusion avec Hosaka finira par provoquer l'annihilation de l'une des deux personnalités. C'est alors qu'une solution, pour le moins radicale, lui apparaît lors du retour de Matsukage. Cette dernière a trouvé le moyen de revenir... mais à quel prix ! Soutenue par un allié puissant, elle a repris forme humaine, devenant quasi immortelle. La tendance est renversée, de chasseurs, les biorg hunters pourraient bien devenir les proies...

La fête d'anniversaire bat son plein et Fumiho Enomoto, bien qu'inquiète de l'absence de ses amis, est loin de se douter des combats sanglants qui se déroulent dans l'ombre. Pour sauver Hôsaka, au seuil de la mort, Fujii a décidé de l'aspirer pour fusionner avec lui. Les deux garçons, qui cohabitent à présent dans un seul et même corps, forment une nouvelle entité : un biorg , un bio bug spécialisé dans le combat. Mais malheureusement, le biorg hunter a désormais toute légitimité pour déployer ses forces et l'éliminer. Fujii va rapidement devoir s'adapter à la situation et à ses nouvelles capacités pour espérer sortir vivant de son premier affrontement...

Chieri Matsukage, alliée d'Ouranos, a attaqué et détourné de sa propre initiative le vaisseau de Necro Maria. Fujii, toujours en formation, est alors mobilisé pour intervenir. Mais tandis qu'il vient pour la libérer, Necro Maria adopte un comportement pour le moins inattendu face à sa kidnappeuse. De son côté, Kiwa ,déjà perturbée par sa récente découverte concernant Fumiho, sombre dans la terreur lorsqu'elle voit le nouveau biorg hunter qu'est devenu Fujii. C'est dans ce climat de confusion que se révèle l'identité de la troisième personne qui compose "Trinity"...

Un virus étrange a fait son apparition dans le monde. Baptisé "Bio Bug", il crée des "trous" de formes diverses sur les mains de l'individu contaminé, permettant ainsi à ce dernier d'absorber un objet de son choix et de fusionner avec. Si le résultat peut se révéler utile ou remarquable, il peut également être des plus terrifiants. C'est en effet ce dont va faire l'expérience Fujii, un jeune lycéen, lorsqu'il écope d'un bug à chaque main. Aidé d'autres "bugglers" : la douce Fumiho, pour laquelle il se meurt d'amour, le brillant Hosa et Kiwako, il va devoir apprendre les règles qui régissent ce nouvel aspect de sa vie. Mais également se protéger du groupe d'assassins sans pitié qui ciblent et déciment leurs semblables : les Biorg Hunters...